کنفرانس مهندسی برق ایران

صفحه اصلی / سی و سومین کنفرانس بین المللی مهندسی برق

A Siamese Neural Network for Predicting snoRNA-Disease Association

نویسندگان :

Milad Besharatifard¹ Fatemeh Zare-Mirakabad²

1- Amirkabir University of Technology (Tehran Polytechnic) 2- Amirkabir University of Technology (Tehran Polytechnic)

کلمات کلیدی :

snoRNA،Disease،Siamese Neural Network،Machine Learning

چکیده :

Small nucleolar RNAs (snoRNAs) are essential in biological processes and are linked to diseases such as cancer and neurodegenerative disorders. Identifying snoRNA-disease associations is challenging due to limited and imbalanced data. To address this, we propose a Siamese Neural Network (SNN) framework that utilizes features derived from 4-mer sequence patterns and DNABERT for snoRNAs, along with binary profiles of diseases based on semantic relationships and phenotype associations. The SNN processes these features through parallel subnetworks, generating embeddings in a shared space to predict associations. Trained with binary cross-entropy and Kullback-Leibler divergence losses, our model achieves superior performance compared to existing methods, with an AUC of 0.91, AUPR of 0.57, and accuracy of 0.91. These results demonstrate the effectiveness of our approach in identifying meaningful snoRNA-disease relationships, offering a scalable and efficient tool for biomarker discovery and therapeutic research.

لیست مقالات

لیست مقالات بایگانی شده

ارائه روشی جهت بهبود عملکرد شبکه‌های بی‌سیم حسگر ناهمگون مبتنی بر برداشت انرژی

محمد فرشته حکمت - علیرضا کشاورز حداد

Design an Intelligent Fault Detection System for Spring-Drive Operating Mechanism of SF6 High Voltage Circuit Breaker Using ADAMS

Milad Tahvilzadeh - Mehdi Aliyari Shooredeli - Ali asghar Razi Kazemi

Design of a Retinal Prosthesis Circuit With In-pixel Edge Detection Capability

Zahra Bonesbordi - Sayed Masoud Sayedi

Adaptive dynamic programming for kinematic control of 3 interconnected wheeled mobile robots

Aliakbar Ghasemzadeh - Roya Amjadifard - Ali Keymasi Khalaji

Differential Protection for Power Transformers Using Tree-based Pipeline Optimization Tool

Reza Afsharisefat - Mohsen Jannati - Mohamad Reza Shams

ادغام حسگرهای رادار، لیدار و دوربین به منظور بهبود عملکرد در تشخیص اهداف برای کاربرد خودروهای خودران

سید مسعود معصومی زاده - محمد سجادی - طاها محقق - منصور نادرپور - صادق شاه سنایی - محمد علی مددی - زهرا کاوه وش - علی فتوت احمدی

HyperSpectral Image Classification using a 3D Convolutional Mixer Block

Sara Dianat - Mehran Yazdi

Solving the inverse problem for EEG signals when learning a new motor task using GRU neural network

Milad Khosravi - Fariba Bahrami - Behzad Moshiri - Ahmad Kalhor

الگوریتم تشخیصی برای طبقه بندی سرطان خون لوسمی لنفوسیتی حاد با استفاده از شبکه های عصبی عمیق در یادگیری آنلاین

رضا گودرزی - علی جلالی - امید هاشمی پورتفرشی

A High Gain Transformerless DC-DC Boost Converter Using LCD Network: Design and Experimental Verification

Hamed Hokmali - Ebrahim Afjei

ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 40.4.2