کنفرانس مهندسی برق ایران

صفحه اصلی / سی و سومین کنفرانس بین المللی مهندسی برق

A Siamese Neural Network for Predicting snoRNA-Disease Association

نویسندگان :

Milad Besharatifard¹ Fatemeh Zare-Mirakabad²

1- Amirkabir University of Technology (Tehran Polytechnic) 2- Amirkabir University of Technology (Tehran Polytechnic)

کلمات کلیدی :

snoRNA،Disease،Siamese Neural Network،Machine Learning

چکیده :

Small nucleolar RNAs (snoRNAs) are essential in biological processes and are linked to diseases such as cancer and neurodegenerative disorders. Identifying snoRNA-disease associations is challenging due to limited and imbalanced data. To address this, we propose a Siamese Neural Network (SNN) framework that utilizes features derived from 4-mer sequence patterns and DNABERT for snoRNAs, along with binary profiles of diseases based on semantic relationships and phenotype associations. The SNN processes these features through parallel subnetworks, generating embeddings in a shared space to predict associations. Trained with binary cross-entropy and Kullback-Leibler divergence losses, our model achieves superior performance compared to existing methods, with an AUC of 0.91, AUPR of 0.57, and accuracy of 0.91. These results demonstrate the effectiveness of our approach in identifying meaningful snoRNA-disease relationships, offering a scalable and efficient tool for biomarker discovery and therapeutic research.

لیست مقالات

لیست مقالات بایگانی شده

طبقه‌بندی تصاویر سلولی پاپ اسمیر مبتنی بر الگوریتم‌های ترتیبی یادگیری جمعی و شبکه‌های عمیق استخراج ویژگی

زهرا کمالی - محمدصادق هل فروش - کامران کاظمی - مژگان اکبرزاده

Design of a High-Efficiency RF Energy Harvesting System

Saeed Abbasi FallahPour - Shokrollah Karimian - ٍEsfandiar Mehrshahi

نحوه کنترل سطوح هوشمند با قابلیت تنظیم مجدد در راستای مقابله با استراق سمع کننده ها

محمد کاظم ناطقی - زلفا زینل پور یزدی

الگوریتم تشخیصی برای طبقه بندی سرطان خون لوسمی لنفوسیتی حاد با استفاده از شبکه های عصبی عمیق در یادگیری آنلاین

رضا گودرزی - علی جلالی - امید هاشمی پورتفرشی

Giant Optical Nonreciprocity with Magnetized Epsilon-Near-Zero Materials

Zahra Chamani - Abolghasem Zeidaabadi Nezhad - Mahyar Dehdast - Zaker Hossein Firouzeh

پایدارسازی سیستم های چند ورودی-چند خروجی n-بعدی با استفاده از تساوی بزوت، تئوری متباین و نمایش کسری-ماتریسی سیستم

سعید پورمیرزایی - وحید صفری دهنوی - مسعود شفیعی

Validation of statistical models for direction of arrival, time of arrival and received power in a simple indoor Terahertz channel

Sina Sheybani - Amir ahmad Shishegar

Image denoising using convolutional neural network

Behnam Latifi - Abolghasem Raie

A Decentralized Nonlinear Control Strategy for a Robust Voltage Regulation in Islanded DC Microgrids with ZIP Loads

Somayeh Bahrami

مدلسازی محدودیت های عملی سیستم های ترکیبی انرژی الکتریکی- حرارتی با استفاده از تبدیلات پیشرفته برنامه‌ریزی ریاضی

ریحانه حسن آبادی - حسین شریف زاده

ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 40.4.2