0% Complete
صفحه اصلی
/
سی و سومین کنفرانس بین المللی مهندسی برق
A Siamese Neural Network for Predicting snoRNA-Disease Association
نویسندگان :
Milad Besharatifard
1
Fatemeh Zare-Mirakabad
2
1- Amirkabir University of Technology (Tehran Polytechnic)
2- Amirkabir University of Technology (Tehran Polytechnic)
کلمات کلیدی :
snoRNA،Disease،Siamese Neural Network،Machine Learning
چکیده :
Small nucleolar RNAs (snoRNAs) are essential in biological processes and are linked to diseases such as cancer and neurodegenerative disorders. Identifying snoRNA-disease associations is challenging due to limited and imbalanced data. To address this, we propose a Siamese Neural Network (SNN) framework that utilizes features derived from 4-mer sequence patterns and DNABERT for snoRNAs, along with binary profiles of diseases based on semantic relationships and phenotype associations. The SNN processes these features through parallel subnetworks, generating embeddings in a shared space to predict associations. Trained with binary cross-entropy and Kullback-Leibler divergence losses, our model achieves superior performance compared to existing methods, with an AUC of 0.91, AUPR of 0.57, and accuracy of 0.91. These results demonstrate the effectiveness of our approach in identifying meaningful snoRNA-disease relationships, offering a scalable and efficient tool for biomarker discovery and therapeutic research.
لیست مقالات
لیست مقالات بایگانی شده
A Practical ACO-OFDM Link with an Efficient Timing Recovery Pattern
Maryam Sadeghi - Masoud Johar - Mahdi Shabany
Non-contact Radar Technology and Machine Learning for Automated Sleep Apnea-Hypopnea Syndrome Detection
ُSaman Faridsoltani - Mohaddeseh Sadeghi - Zahra Rahmani - Somayyeh Chamaani
A compact 5G MIMO antenna with reduced mutual coupling
Marziyeh Amiri - Ali Ghafoorzadeh-yazdi - Abbas-Ali Heidari
طراحی کنترل کننده مقاوم برای مدل غیرخطی بیماری کووید-19
آرمان مرزبان - الهام امینی بروجنی
یک روش موازی برای تخمین حالت سریع در سیستم های قدرت با ابعاد بزرگ با استفاده از تکنیک جداسازی گراف
بهنام کریم سرمدی - احمد صالحی دوبخشری
کاهش نویز و کلاتر در تصاویر رنگی داپلر اولترسوند
بهینا علیزاده - سید محمود سخایی
System Sectioning to Retain Durability of an Inverter-Based Microgrid
Sara Noorollah
On spatiotemporal-aware deep neural networks for real-time video fire detection: empowering image-based models with temporal and spatial features of video
Mahdi Shamisavi - Sahar Eslami - Amir Jahanshahi - Morteza Rajabzadeh
تخمین غلظت ید و زینان در یک نیروگاه هستهای با استفاده از فیلتر کالمن بیرد تحت شرایط مختلف توان راکتور
حسین زحمتکش - حسین الیاسی
بررسی نامتعادلی در مبدل DC به DC تمامپل شیفت فاز با یکسوکنندهی دوبرابرکنندهی جریان
رضا نرئی - یاسر کریمی - محمدهادی زارع
بیشتر
ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 43.6.0
