کنفرانس مهندسی برق ایران

صفحه اصلی / سی امین کنفرانس بین المللی مهندسی برق

شناسایی کمپلکس ‎های پروتئینی با رویکرد خوشه ‎بندی EM و با استفاده از داده ‎های زیستی

نویسندگان :

مریم مولی وردیخانی¹ سعید جلیلی²

1- دانشگاه تربیت مدرس 2- دانشگاه تربیت مدرس

کلمات کلیدی :

داده بیان ژن، داده TAP، شبکه برهمکنش پروتئین، کمپلکس پروتئینی، گراف هستان شناسی ژن.

چکیده :

شناسایی کمپلکس‎‎ های پروتئینی از روی شبکه‎ های برهمکنش پروتئینی یکی از وظایف بنیادی در بیوانفورماتیک است. روش ‎های آزمایشگاهی داده ‎های با ارزشی برای استنتاج کمپلکس‎ های پروتئینی فراهم کرده‎ اند. با این وجود، این روش ‎ها محدودیت‎ های ذاتی دارند. با توجه به این محدودیت‎ ها، در دهه گذشته روش‌های محاسباتی بسیاری برای شناسایی کمپلکس ‎های پروتئینی، ارائه شده‎ اند. در بسیاری از روش‎ های ارائه شده ماهیت پویا و هم ‎پوشانی کمپلکس‎ های پروتئینی نادیده گرفته می ‎شود. در این طرح، روشی با استفاده از شبکه برهمکنش پروتئین، داده ‎های بیان ژن، گراف هستان‎ شناسی ژن، داده TAP و الگوریتم خوشه ‎بندی EM برای شناسایی کمپلکس ‎های پروتئینی ارائه شده است. نتایج آزمایش ‎ها نشان می‎ دهد این روش نسبت به سایر روش ‎های به روز شناسایی کمپلکس ‎های پروتئینی عملکرد بهتری دارد.